使用ggplot2绘制read-depth line图

上一次说完绘制堆积柱状图之后，由于课题需要绘制geom_line图，也就是线图，
秉着公正公开的原则，就写一个短文来记录一下这个过程

开搞

在一个线图中，观察值都按照x排列并连接起来。

可以使用函数geom_line()、geom_step()或geom_path()。
图得类型大概如下：

数据

我们这里使用的数据来就是来自于个人课题的数据
数据格式举例如下：

name            depth   count
contig001   1           199
contig001   2           211
contig002   1           87
contig002   2           103
contig002   3            99          

绘图

getwd()
library(ggplot2)
mytest<-read.table(file="inputfile")
#对重复的单个点数据取最大值。
mytest=mytest[!duplicated(mytest[,c(2)], fromLast=TRUE),]
names(mytest)<-c("name","depth","count")
#对p变量直接运行结果并打印
(p <- ggplot(mytest,aes(x=depth,y=count))+geom_line(col="#0000CD",size=2)+xlim(0,200)+theme_classic())

结果

更多的内容就交给ggplot2的贵的了